儿童时期慢性腹痛是由功能性或器质性原因引起的持久间歇性或持续性腹痛，据估计有13%~17%的儿童曾发生过慢性腹痛。其病因主要分为3个方面：1）胃肠道器质性疾病；2）非胃肠道器质性疾病；3）功能性腹痛。
其中功能性胃肠病目前机制不是很明确，有多种学说，有人认为涉及肠神经系统、中枢神经系统、内脏痛觉过敏、心理因素、对正常和异常生理刺激的异常反应等。根据罗马III的诊断标准，又将功能性胃肠病分为以下几种类别：
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